رفیع الدین سیدمحمد نائینی اصفهانی

1. اجوبة­المسائل2.اسماءالحسنی3.التّشکیک5. حاشیه بر استبصار شیخ طوسی 4. ثمرة شجرة الهیه 6.حاشیه بر اصول کافی یا شرح اصول کافی7.حاشیة شرح اشارات 8.حاشیه بر ارشاد الاذهان9.حاشیه بر ارشاد الاذهان 10.حاشیه بر شرح حکمة­العین 11.حاشیه بر شرح حکمة­العین میرک بخاری 12.حاشیه بر شرح مطالع» در منطق13.حاشیه بر شرح مختصرالاصول ابن حاجب عضدی 14. حاشیه یا شرح بر صحیفة سجادیه15.حاشیه بر قواعد 16.حاشیه بر مختلف­الشیعة 17. حاشیه بر مدارک­الاحکام 18. حاشیه بر معالم­الاصول شیخ حسن بن زین­الدّین عاملی 19. حاشیه یا شرح نهج­البلاغه20.رسالة فی شبهة­الاستلزام و جوابها21.رساله در شبهة تناقض22.رساله در تحریم تسمیه صاحب­الزّمان(عج) یا رسالة تحریمیه 23.رساله در سریان وجود24.رساله­ای در صرف و نحو25. رساله­ای در صلاة جمعه 26. رساله­ای مشتمل بر علم الهی 27. رساله­ای در کلام 28.رساله­ای در فقه 29.شرح حدیث حدوث­الاسما30 .شجرة الهیه 31.فتوایی در ذم صوفیه32. مکتوبات و نامه­ها